下咽鳞状细胞癌TPF方案诱导化疗敏感性差异基因的初步分析

更新时间:2023-05-28

【摘要】目的 应用基因表达谱芯片,筛选下咽鳞状细胞癌患者对紫杉醇+顺铂+5-氟尿嘧啶(TPF)方案诱导化疗敏感性的差异表达基因,并进行初步分析。方法 选取2013年1月至2017年12月北京同仁医院头颈外科29例原发下咽鳞状细胞癌患者(男28例,女1例,年龄43～73岁)TPF方案诱导化疗治疗前的新鲜肿瘤标本。分为诱导化疗敏感组(16例)和不敏感组(13例)。应用Illumina人类全基因组表达芯片检测2组的表达差异,对差异基因进行生物信息学分析。在29例样本基础上增加符合入组条件的14例样本,应用反转录实时定量聚合酶链反应(reverse transcription and quantitative real-time PCR,RT-qPCR)技术检测潜在功能核心基因在诱导化疗敏感组患者及诱导化疗不敏感组患者组织中表达的差异。采用Graphpad prism 7.0软件对测量结果进行统计分析。结果 共筛选出1 381个差异基因。经GO(Gene Ontology)数据库分析,功能上调的集合主要包括：细胞外基质隔离、趋化因子受体结合、钾离子通道调节活性等集合；下调的集合包括：血管生成调节、钙离子结合、自然杀伤细胞免疫应答活性等集合。经KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库分析,下调通路主要有：细胞外基质受体相互作用通路、过氧化物酶体通路等；上调通路主要有：谷胱甘肽代谢通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptor,PPAR)信号通路等。其中CD44、IL-6R分别为表达下调基因和上调基因,可能位于核心功能调控位置。经RT-qPCR检测,CD44 mRNA在诱导化疗不敏感组织中相对表达量(0.54±0.06)显著高于诱导化疗敏感组织(0.33±0.04)中相对表达量(P<0.01)；IL-6R mRNA在诱导化疗不敏感组织中相对表达量(0.44±0.03)显著低于诱导化疗敏感组织中相对表达量(0.68±0.03),差异有统计学意义(P<0.01)。结论 CD44、IL-6R可能是下咽鳞状细胞癌TPF诱导化疗敏感性相关的潜在功能性基因。

【关键词】 下咽肿瘤 癌 鳞状细胞 基因表达谱 诱导化疗 生物信息学

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